Data Scientist, Pflanzenwissenschaftler - Bioinformatik (m/w/d)

Beschreibung

Forschung für eine Gesellschaft im Wandel: Das ist unser Antrieb im Forschungszentrum Jülich. Als Mitglied der Helmholtz-Gemeinschaft stellen wir uns großen gesellschaftlichen Herausforderungen unserer Zeit und erforschen Optionen für die digitalisierte Gesellschaft, ein klimaschonendes Energiesystem und ressourcenschützendes Wirtschaften. Arbeiten Sie gemeinsam mit rund 7.100 Kolleginnen und Kollegen in einem der größten Forschungszentren Europas und gestalten Sie den Wandel mit uns!

Daten sind die neue Ressource des 21. Jahrhunderts und die Datenverfügbarkeit scheint endlos zu sein. Möchten Sie einen Teil des Daten-Beziehungs-Lebenszyklus für die Pflanzenwissenschaft etablieren? Dann sind Sie am Institutsbereich Bioinformatik (IBG-4) des Instituts für Bio- und Geowissenschaften des Forschungszentrums Jülich genau richtig.

Das IBG-4 bearbeitet und entwickelt Methoden und Algorithmen, um ein grundlegendes Verständnis insbesondere von hochdimensionalen Daten und Prozessen in der Bioökonomie zu erzielen. Das IBG-4 konzentriert sich auf Wissensmanagement und Datenintegration, klassische Bioinformatik und maschinelles Lernen, insbesondere für die Vorhersage von Phänotypen zu biologischen Fragen, die die transkriptionelle Umprogrammierung von Pflanzen während der abiotischen Stressantwort, die Identifizierung von Stoffwechselwegen für Sekundärmetaboliten und das Verständnis der pflanzlichen Zellwandbiosynthese betreffen.

Verstärken Sie diesen Bereich zum nächstmöglichen Zeitpunkt als

• Tätigkeiten im Bereich der Omics-Bioinformatik an der Kollektion und Kuratierung von Genomdaten mit Fokus auf Epigenomik
• Bearbeitung der Kollektion, Kuratierung und Analyse von Transkriptomdaten und der Konstruktion von Gennetzwerken, basierend auf Genexpressions-Korrelations-Analysen
• Datenerfassung von Projektpartnern und im Bereich der Datenwissenschaften sowie Beteiligung an der Datenversionierung und spezialisierten Visualisierung der Daten
• Präsentation der wissenschaftlichen Ergebnisse auf Projekttreffen und internationalen Fachtagungen
• Veröffentlichung der Ergebnisse in hochrangigen Fachzeitschriften

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium auf dem Gebiet der Data Science und/oder Pflanzenwissenschaften oder ähnlicher Abschluss mit einschlägiger und nachgewiesener Erfahrung im Aufgabengebiet
• Erfahrung mit Linux-Betriebssystemen (Shell)
• Gute Kenntnisse im Shell Scripting (Bash) und in der Programmierung mit R
• Erfahrung in der webbasierten Datenvisualisierung, vorzugsweise mit JavaScript (z.B. D3.js, Plotly.js)
• Erfahrung mit Frameworks zur Erstellung sogenannter „single page applications“, wie React.js
• Vorzugsweise Erfahrung in Datenbanken: relational (PostgreSQL), dokumentbasiert (MongoDB), Apache Cassandra und Apache Hive mit Presto von Facebook und graphenbasierte DBs (Neo4j)
• Vorzugsweise Erfahrung in der Webentwicklung (Server und Front-End) mit Node.js
• Gute organisatorische Fähigkeiten und die Fähigkeit, unabhängig zu arbeiten
• Sehr gute Kooperations- und Kommunikationsfähigkeit sowie die Fähigkeit, als Teil eines verteilten Teams in einem internationalen und interdisziplinären Umfeld zu arbeiten
• Kommunikationsfähigkeit in Englisch ist obligatorisch

Wir arbeiten an hochaktuellen gesellschaftlich relevanten Themen und bieten Ihnen die Möglichkeit, den Wandel aktiv mitzugestalten! Wir unterstützen Sie in Ihrer Arbeit durch:

• Einen großen Forschungscampus im Grünen, der beste Möglichkeiten zur Vernetzung mit Kolleginnen und Kollegen sowie zum sportlichen Ausgleich neben der Arbeit bietet
• Interdisziplinäre Datenwissenschaft und angewandte Bioinformatik in einem hochproduktiven Forschungsprojekt
• Ein umfangreiches Weiterbildungsangebot
• Vielfältige Angebote zur Vereinbarung von Beruf und Familie
• Die Möglichkeit zum (orts-)flexiblen Arbeiten, z.B. im Homeoffice
• Flexible Arbeitszeitmodelle, die Möglichkeit zur vollzeitnahen Teilzeit sowie 30 Urlaubstage im Jahr

Wir bieten Ihnen eine spannende und abwechslungsreiche Aufgabe in einem internationalen und interdisziplinären Arbeitsumfeld. Die Stelle ist zunächst auf zwei Jahre befristet mit der Möglichkeit einer längerfristigen Perspektive. Vergütung und Sozialleistungen erfolgen nach dem Tarifvertrag für den öffentlichen Dienst (TVöD-Bund); in Abhängigkeit von den vorhandenen Qualifikationen und je nach Aufgabenübertragung ist eine Eingruppierung im Bereich der Entgeltgruppe E 13 TVöD-Bund vorgesehen.